近年来，国内跨境电子商务呈现出迅猛发展态势。尽管我国的电子商务企业正面临日益激烈的市场竞争，跨境电子商务还是蕴藏着巨大的 发展潜力，跨境电子商务物流也拥有良好的发展前景，但其发展也并非 一帆风顺。 现如今，迅速崛起的跨境电子商务需要克服的阻力主要包括：物流效 率低下、成本难以降低、无法实时追踪物流状态、缺乏便利性等问题。不 仅如此，各国环境的不同进一步提高了建设国际物流运输配送体系的难度。 不同国家、地区的经济活动都会对跨境物流的发展产生影响。
此外， 文化背景及其他因素也会作用于跨境物流的运营。近几年，飞机失事频发， 现代物流渠道在诸多因素的影响下产生波动，导致国际航空货运的需求增 长十分缓慢，增加了跨境物流运输体系的建设难度。目前，我国跨境物流 的发展尚处于探索时期，未来，应该将粗放型转变为集约型，逐步解决跨 境物流在发展过程中存在的问题。 跨境贸易与跨境物流共同构成跨境电子商务，其中，跨境物流涉及本 土物流、国内外海关、国际运输、末端配送等多个流程的运作。其产业链 包含众多环节，增加了海关通关的难度，也提高了跨境电子商务的风险。 不仅如此，企业还要为跨境物流提供足够的资金、资源支持。
运营成本是所有企业在发展过程中都不能忽视的因素，企业运营是为 了实现盈利，跨境电子商务物流企业也不例外，其经营者必须对成本问题 进行全面分析。现如今，运营成本居高不下是跨境电子商务物流企业必需要解决的问题之一。 成本过高会给企业发展带来不利影响。一方面，过高的成本会压缩企 业的利润空间，导致企业在竞争中处于劣势地位；另一方面，成本过高会 阻碍企业的进一步发展，使企业陷入困境。所以，物流企业要想获得持续 性的发展，就要转变发展方式，减少运营过程中的成本消耗。 即使专线物流、邮政小包也有可能出现包裹破损、遗失的问题。跨境物流在货品运输及配送途中出现这种问题，会降低顾客的整体消费体验，并增加商家的运营成本，还会导致客户因对物流服务不满意而转向 其他平台。 除了包裹破损、遗失之外，跨境电子商务还要解决退换货问题。这类 问题可能发生在跨境物流运营的所有环节中。跨境电子商务在物流环节可 能出现送货延迟、产品质量达不到预期、货品损坏、遗失、配送地址不准 确、海关扣留等情况，导致退换货物流的产生。
在海关通关方面，部分跨境电子商务企业不注重了解目的国的海关监管制度，有些目的国对外来商品的审核十分严格。此外，汇率问题也会对跨境电子商务产生影响。币值的变化会导致税率波动，可能导致跨境电子商务企业的利润空间被压缩。
